358c98e1-534d-4ed4-9853-13a5f437d79c eng; CAN utf8; utf8 dataset; jeuDonnées CESD Data Manager / DSEC Gestionnaire de données Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) 125 Marine Science Drive 125, promenade Marine Science St. Andrews New Brunswick Nouveau-Brunswick E5B0E4 Canada Canada (le) DFO.CESDDataRequest-DSECDemandededonnes.MPO@dfo-mpo.gc.ca DFO.CESDDataRequest-DSECDemandededonnes.MPO@dfo-mpo.gc.ca https pointOfContact; contact 2025-10-17T14:52:17.329Z North American Profile of ISO 19115:2003 - Geographic information - Metadata Profil nord-américain de la norme ISO 19115:2003 - Information géographique - Métadonnées CAN/CGSB-171.100-2009 French; Français Canada; Canada utf8; utf8 EPSG:4326 https://epsg.io 8.2.6 Quantitative PCR (qPCR) of key macroalgal non-indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick waters PCR quantitative (qPCR) des principales espèces de macroalgues non indigènes dans les eaux de la Nouvelle-Écosse et du Nouveau-Brunswick 2024-10-16 publication; publication 2024-08-07 creation; création Kira Krumhansl Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) Kira.Krumhansl@dfo-mpo.gc.ca Kira.Krumhansl@dfo-mpo.gc.ca https principalInvestigator; chercheurPrincipal Claudio DiBacco Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) Claudio.DiBacco@dfo-mpo.gc.ca Claudio.DiBacco@dfo-mpo.gc.ca principalInvestigator; chercheurPrincipal Cody Brooks Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) cody.brooks@dfo-mpo.gc.ca cody.brooks@dfo-mpo.gc.ca collaborator; collaborateur Ben Lowen Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) ben.lowen@dfo-mpo.gc.ca ben.lowen@dfo-mpo.gc.ca collaborator; collaborateur Kira Krumhansl Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) Kira.Krumhansl@dfo-mpo.gc.ca Kira.Krumhansl@dfo-mpo.gc.ca resourceProvider; fournisseurRessource To support the surveillance of key macroalgae and non-indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick, five quantitative PCR (qPCR) assays were designed and tested at 111 sites in 2022-2023 targeting the following non-indigenous macroalgal species: Antithamnion sparsum, Bonnemaisonia hamifera, Codium fragile, Dasysiphonia japonica, Fucus serratus. All assays were developed in 2022 by the Center for Environmental Genomics Applications (CEGA, Newfoundland, Canada) except Antithamnion sparsum, for which an assay was developed in 2023 by the Aquatic Biotechnology Laboratory (ABL) at the Bedford Institute of Oceanography. All amplification was performed by the ABL in 2022-2023. The assay developed for Fucus serratus was later determined to be non-specific, and amplifies both F. serratus and Fucus distichus. Cite this data as: Krumhansl K, Brooks C, Lowen B, DiBacco C, (2025). Quantitative PCR (qPCR) of Key Macroalgal Non-Indigenous Species in Nova Scotia and New Brunswick Waters. Version 1.5. Fisheries and Oceans Canada. Samplingevent dataset. https://ipt.iobis.org/obiscanada/resource?r=quantitative_qpcr_macroalgal_nonindigenous_species_novascotia_newbrunswick_2022_2023&v=1.5 For additional information please see: LeBlanc F., Belliveau V., Watson E., Coomber C., Simard N., DiBacco C., Bernier R., Gagné N. 2020. Environment DNA (eDNA) detection of marine aquatic invasive species (AIS) in Eastern Canada using a targeted species-specific qPCR approach. Management of Biological Invasions 11(2):201-217 Krumhansl K.A., Brooks C.M., Lowen B., O’Brien J., Wong M., DiBacco C. Loss, resilience and recovery of kelp forests in a region of rapid ocean warming. Annals of Botany 2024 Mar 8; 133(1):73-92 Brooks C.M., Krumhansl K.A. 2023. First record of the Asian Antithamnion sparsum Tokida, 1932 (Ceramiales, Rhodophyta) in Nova Scotia, Canada. BioInvasions Records 12(3):745-725. Pour soutenir la surveillance des principales espèces de macroalgues et non indigènes en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick, on a conçu et testé cinq essais de PCR quantitative (qPCR) et sur 111 sites en 2022-2023, ciblant les espèces de macroalgues non indigènes suivantes : Antithamnion sparsum, Bonnemaisonia hamifera, Codium fragile, Dasysiphonia japonica et Fucus serratus. Tous les essais ont été élaborés en 2022 par le Center for Environmental Genomics Applications (CEGA, à Terre-Neuve, au Canada), à l’exception de l’essai pour Antithamnion sparsum, pour lequel un essai a été élaboré en 2023 par le Laboratoire de biotechnologie aquatique (LBA) de l’Institut océanographique de Bedford. Toutes les amplifications ont été effectuées par le LBA en 2022-2023. Le test mis au point pour Fucus serratus s’est avéré par la suite non spécifique et amplifie à la fois F. serratus et Fucus distichus. Citer ces données comme: Krumhansl K, Brooks C, Lowen B, DiBacco C, (2025). Quantitative PCR (qPCR) of Key Macroalgal Non-Indigenous Species in Nova Scotia and New Brunswick Waters. Version 1.5. Fisheries and Oceans Canada. Samplingevent dataset. https://ipt.iobis.org/obiscanada/resource?r=quantitative_qpcr_macroalgal_nonindigenous_species_novascotia_newbrunswick_2022_2023&v=1.5 Pour plus d'informations, voir: LeBlanc F., Belliveau V., Watson E., Coomber C., Simard N., DiBacco C., Bernier R., Gagné N. 2020. Environment DNA (eDNA) detection of marine aquatic invasive species (AIS) in Eastern Canada using a targeted species-specific qPCR approach. Management of Biological Invasions 11(2):201-217 Krumhansl K.A., Brooks C.M., Lowen B., O’Brien J., Wong M., DiBacco C. Loss, resilience and recovery of kelp forests in a region of rapid ocean warming. Annals of Botany 2024 Mar 8; 133(1):73-92 Brooks C.M., Krumhansl K.A. 2023. First record of the Asian Antithamnion sparsum Tokida, 1932 (Ceramiales, Rhodophyta) in Nova Scotia, Canada. BioInvasions Records 12(3):745-725. completed; complété notPlanned; nonPlanifié https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/358c98e1-534d-4ed4-9853-13a5f437d79c/attachments/Thumbnail.PNG Survey locations for the quantitative PCR of key macroalgal Non-Indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick Lieux d'enquête pour la PCR quantitative des principales espèces non indigènes de macroalgues en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick eDNA ADNe Non-indigenous species Espèces non indigènes Macroalgae Macroalgues Invasive species Espèce envahissante Oceans Océan Coastal waters Eaux côtières theme; thème Government of Canada Core Subject Thesaurus Thésaurus des sujets de base du gouvernement du Canada 2004 publication; publication 2016-07-04 creation;création geonetwork.thesaurus.external.theme.GC_Core_Subject Government of Canada; Library and Archives Canada Gouvernement du Canada; Bibliothèque et Archives Canada custodian; conservateur New Brunswick Nouveau-Brunswick Nova Scotia Nouvelle-Écosse theme; thème Canada/US States and Provinces Canada/US États et provinces 2025-10-17 publication; publication 2025-10-17 creation;création geonetwork.thesaurus.external.theme.GC_State_Province Government of Canada; Library and Archives Canada Gouvernement du Canada; Bibliothèque et Archives Canada custodian; conservateur Open Government Licence - Canada (http://open.canada.ca/en/open-government-licence-canada) Licence du gouvernement ouvert - Canada (http://ouvert.canada.ca/fr/licence-du-gouvernement-ouvert-canada) license; licence license; licence unclassified; nonClassifié vector; vecteur eng; CAN utf8; utf8 oceans environment biota 2022-07-08 2023-10-15 -67.2838 -59.6894 43.3951 47.0481 ESRI REST 2.9.8 CSV 1 FGDB/GDB 2.7.0 Data Acquisition Assembly and Distribution / Acquisition, assemblage et distribution de donnée Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 L'institut océanographique de Bedford, C.P. 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) DataServicesDonnees@dfo-mpo.gc.ca DataServicesDonnees@dfo-mpo.gc.ca https distributor; distributeur https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/358c98e1-534d-4ed4-9853-13a5f437d79c/attachments/Event.csv HTTPS Event data of the quantitative PCR of key macroalgal non-Indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick Données sur les événements de la PCR quantitative des principales espèces non indigènes de macroalgues en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick Dataset;CSV;eng,fra Données;CSV;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/358c98e1-534d-4ed4-9853-13a5f437d79c/attachments/Occurrence.csv HTTPS Occurrence data of the quantitative PCR of key macroalgal non-Indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick Données d'occurrence de la PCR quantitative des principales espèces non indigènes de macroalgues en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick Dataset;CSV;eng,fra Données;CSV;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/358c98e1-534d-4ed4-9853-13a5f437d79c/attachments/extendedMeasurementOrFact.csv HTTPS Extended measurement or facts data of the quantitative PCR of key macroalgal non-Indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick Mesures étendues ou données factuelles de la PCR quantitative des principales espèces non indigènes de macroalgues en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick Dataset;CSV;eng,fra Données;CSV;eng,fra https://egisp.dfo-mpo.gc.ca/arcgis/rest/services/open_data_donnees_ouvertes/qpcr_of_key_macroalgal_non_indigenous_species/MapServer ESRI REST: Map Service Quantitative PCR of key macroalgal non-Indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick PCR quantitative des principales espèces non indigènes de macroalgues en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick Web Service;ESRI REST;eng Service Web;ESRI REST;eng https://egisp.dfo-mpo.gc.ca/arcgis/rest/services/open_data_donnees_ouvertes/qpcr_of_key_macroalgal_non_indigenous_species/MapServer ESRI REST: Map Service Quantitative PCR of key macroalgal non-Indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick PCR quantitative des principales espèces non indigènes de macroalgues en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick Web Service;ESRI REST;fra Service Web;ESRI REST;fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/358c98e1-534d-4ed4-9853-13a5f437d79c/attachments/Data_Dictionary.csv HTTPS Data dictionary Dictionnaire de données Supporting Document;CSV;eng,fra Document de soutien;CSV;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/358c98e1-534d-4ed4-9853-13a5f437d79c/attachments/qPCR_NS_NB_Macroalgal_NonIndigenous_Species_2022_2023.csv HTTPS Survey locations for the quantitative PCR of key macroalgal Non-Indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick Lieux d'enquête pour la PCR quantitative des principales espèces non indigènes de macroalgues en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick Dataset;CSV;eng,fra Données;CSV;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/358c98e1-534d-4ed4-9853-13a5f437d79c/attachments/Quantitative_PCRKey_Macroalgal_NonIndigenous_Species_NovaScotia_NewBrunswick.zip HTTPS Survey locations for the quantitative PCR of key macroalgal Non-Indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick Lieux d'enquête pour la PCR quantitative des principales espèces non indigènes de macroalgues en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick Dataset;FGDB/GDB;eng,fra Données;FGDB/GDB;eng,fra