436d5c50-8da6-483f-9705-91ecd6dc5c56 eng; CAN utf8; utf8 dataset; jeuDonnées CESD Data Manager / DSEC Gestionnaire de données Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Data Manager Gestionnaire de données 125 Marine Science Drive 125 promenade Marine Science St. Andrews New Brunswick Nouveau-Brunswick E5B 0E4 Canada Canada (le) DFO.CESDDataRequest-DSECDemandededonnes.MPO@dfo-mpo.gc.ca DFO.CESDDataRequest-DSECDemandededonnes.MPO@dfo-mpo.gc.ca https pointOfContact; contact 2025-01-31T00:26:02.998Z North American Profile of ISO 19115:2003 - Geographic information - Metadata Profil nord-américain de la norme ISO 19115:2003 - Information géographique - Métadonnées CAN/CGSB-171.100-2009 French; Français Canada; Canada utf8; utf8 EPSG:4326 https://epsg.io 8.2.6 Evaluating an Autonomous eDNA Sampler for Marine Environmental Monitoring: Short- and Long-Term Applications Évaluation d’un échantillonneur autonome d’ADNe pour la surveillance du milieu marin : Applications à court et à long terme 2024-11-29 publication; publication 2024-10-23 creation; création Nick Jeffery Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) nick.jeffery@dfo-mpo.gc.ca nick.jeffery@dfo-mpo.gc.ca principalInvestigator; chercheurPrincipal Mallory Van Wyngaarden Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) mallory.vanwyngaarden@dfo-mpo.gc.ca mallory.vanwyngaarden@dfo-mpo.gc.ca collaborator; collaborateur Ryan Stanley Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) ryan.stanley@dfo-mpo.gc.ca ryan.stanley@dfo-mpo.gc.ca collaborator; collaborateur We evaluated an autonomous environmental DNA sampler produced by Dartmouth Ocean Technologies Inc (Dartmouth, Canada) compared to time-at-sample filtration in the laboratory to determine the performance of moored samplers for monitoring in the marine world. We deployed three autonomous samplers from DOT in the Bedford Basin (Canada) over a nine-week period in summer/fall 2023. The samplers filtered seawater in situ at programmed interviews over this time period, and we collected contemporaneous samples with a standard vacuum pump during each sampling period. Both eDNA sample types captured similar fish diversity, including typical diversity for the Northwest Atlantic. The invertebrate community detected using the COI marker was different between each sample type, likely due to differences in filter pore size. We found biofouling on the moored samplers was minimal over the study period, even in a high-traffic area such as the Bedford Basin, likely due to the relatively short experimental period, and copper screening covering in the inlet and outlet valves of the instruments. Overall, our results show promise to deploy autonomous eDNA samplers in marine conservation areas to contribute to monitoring in the temperate ocean, but further testing over longer periods of time is needed to determine if DNA remains well-preserved in the autonomous samplers at ambient ocean temperatures. Cite this data as: Jeffery, N.W., Van Wyngaarden, M., and Stanley, R.R.E. Evaluating an Autonomous eDNA Sampler for Marine Environmental Monitoring: Short- and Long-Term Applications. Published: December 2024. Coastal Ecosystems Science Division, Maritimes Region, Fisheries and Oceans Canada, Dartmouth NS. Nous avons évalué un échantillonneur autonome d'ADN environnemental (ADNe) fabriqués par Dartmouth Ocean Technologies Inc. (DOT, Dartmouth, Canada) par rapport au temps de filtration de l'échantillon en laboratoire afin de déterminer la performance des échantillonneurs amarrés pour la surveillance du milieu marin. Nous avons déployé trois échantillonneurs autonomes de DOT dans le bassin de Bedford (Canada) pendant neuf semaines à l’été et à l’automne 2023. Les échantillonneurs ont filtré l'eau de mer in situ lors d'entretiens programmés au cours de cette période, et nous avons recueilli des échantillons contemporains avec une pompe à vide standard au cours de chaque période d'échantillonnage. Les deux types d’échantillons d’ADNe ont capturé une diversité de poissons similaire, y compris la diversité type de l’Atlantique Nord-Ouest. La communauté d’invertébrés détectée à l’aide du marqueur COI était différente d’un type d’échantillon à l’autre, probablement en raison des différences dans la taille des pores du filtre. Nous avons constaté que l'encrassement biologique des échantillonneurs amarrés était minime au cours de la période d'étude, même dans une zone très fréquentée comme le bassin de Bedford, probablement en raison de la période expérimentale relativement courte et du filtre en cuivre couvrant les clapets d’entrée et de sortie des instruments. Dans l’ensemble, nos résultats sont prometteurs en ce qui concerne le déploiement d’échantillonneurs autonomes d’ADNe dans les aires marines de conservation pour contribuer à la surveillance dans l’océan tempéré, mais d’autres essais sur de plus longues périodes sont nécessaires pour déterminer si l’ADN demeure bien préservé dans les échantillonneurs autonomes à des températures océaniques ambiantes. Citer ces données comme: Jeffery, N.W., Van Wyngaarden, M., and Stanley, R.R.E. Évaluation d’un échantillonneur autonome d’ADNe pour la surveillance du milieu marin : Applications à court et à long terme. Publié en Décembre 2024. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É). completed; complété notPlanned; nonPlanifié https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/436d5c50-8da6-483f-9705-91ecd6dc5c56/attachments/Thumbnail.PNG Evaluating an Autonomous eDNA Sampler for Marine Environmental Monitoring: Short- and Long-Term Applications Évaluation d’un échantillonneur autonome d’ADNe pour la surveillance du milieu marin : Applications à court et à long terme Marine Conservation Target Objectifs de Conservation Marine Partnerships Partenariats Marine conservation areas Aire marine de conservation Oceans Océan Coastal waters Eaux côtières Genetics Génétique theme; thème Government of Canada Core Subject Thesaurus Thésaurus des sujets de base du gouvernement du Canada 2004 publication; publication 2016-07-04 creation;création geonetwork.thesaurus.external.theme.GC_Core_Subject Government of Canada; Library and Archives Canada Gouvernement du Canada; Bibliothèque et Archives Canada custodian; conservateur Nova Scotia Nouvelle-Écosse theme; thème Canada/US States and Provinces Canada/US États et provinces 2024-12-20 publication; publication 2024-12-20 creation;création geonetwork.thesaurus.external.theme.GC_State_Province Government of Canada; Library and Archives Canada Gouvernement du Canada; Bibliothèque et Archives Canada custodian; conservateur Open Government Licence - Canada (http://open.canada.ca/en/open-government-licence-canada) Licence du gouvernement ouvert - Canada (http://ouvert.canada.ca/fr/licence-du-gouvernement-ouvert-canada) license; licence license; licence unclassified; nonClassifié vector; vecteur eng; CAN utf8; utf8 oceans biota environment 2023-08-11 2023-10-16 -63.6176 -63.605 44.6807 44.6878 ESRI REST 2.9.8 CSV 1 FGDB/GDB 2.9.8 HTML N/A other FASTA File Data Acquisition Assembly and Distribution / Acquisition, assemblage et distribution de donnée Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) DataServicesDonnees@dfo-mpo.gc.ca DataServicesDonnees@dfo-mpo.gc.ca https distributor; distributeur https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1139183 HTTPS Raw DNA sequences Séquences d'ADN brutes Supporting Document;HTML;eng Document de soutien;HTML;eng https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/436d5c50-8da6-483f-9705-91ecd6dc5c56/attachments/12S-ASV-dna-sequences.fasta HTTPS 12S-ASV DNA sequences 12S-ASV Séquences d'ADN Dataset;ZIP;eng Données;ZIP;eng https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/436d5c50-8da6-483f-9705-91ecd6dc5c56/attachments/COI-ASV-dna-sequences.fasta HTTPS COI-ASV DNA sequences COI-ASV séquences d'ADN Dataset;ZIP;eng Données;ZIP;eng https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/436d5c50-8da6-483f-9705-91ecd6dc5c56/attachments/12S_Taxonomy.csv HTTPS 12S taxonomy 12S taxonomie Dataset;CSV;eng,fra Données;CSV;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/436d5c50-8da6-483f-9705-91ecd6dc5c56/attachments/DOTCOI_Taxonomy.csv HTTPS DOTCOI taxonomy DOTCOI taxonomie Dataset;CSV;eng,fra Données;CSV;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/436d5c50-8da6-483f-9705-91ecd6dc5c56/attachments/Evaluating%20an%20Autonomous%20eDNA%20Sampler.gdb.zip HTTPS Samples from DOT sampler and SmithRoot Échantillons provenant de l'échantillonneur DOT et du SmithRoot Dataset;FGDB/GDB;eng,fra Données;FGDB/GDB;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/436d5c50-8da6-483f-9705-91ecd6dc5c56/attachments/Samples_DOTSampler_SmithRoot.csv HTTPS Samples from DOT sampler and SmithRoot Échantillons provenant de l'échantillonneur DOT et du SmithRoot Dataset;CSV;eng,fra Données;CSV;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/436d5c50-8da6-483f-9705-91ecd6dc5c56/attachments/Data_dictionary.csv HTTPS Data dictionary Dictionnaire de données Supporting Document;CSV;eng,fra Document de soutien;CSV;eng,fra https://egisp.dfo-mpo.gc.ca/arcgis/rest/services/open_data_donnees_ouvertes/evaluating_edna_sampler_marine_monitoring/MapServer ESRI REST: Map Service Evaluating an Autonomous eDNA Sampler for Marine Environmental Monitoring: Short- and Long-Term Applications Évaluation d’un échantillonneur autonome d’ADNe pour la surveillance du milieu marin : Applications à court et à long terme Web Service;ESRI REST;eng Service Web;ESRI REST;eng https://egisp.dfo-mpo.gc.ca/arcgis/rest/services/open_data_donnees_ouvertes/evaluating_edna_sampler_marine_monitoring/MapServer ESRI REST: Map Service Evaluating an Autonomous eDNA Sampler for Marine Environmental Monitoring: Short- and Long-Term Applications Évaluation d’un échantillonneur autonome d’ADNe pour la surveillance du milieu marin : Applications à court et à long terme Web Service;ESRI REST;fra Service Web;ESRI REST;fra