91baebd7-0832-455c-a4bf-67a1d0d6672d eng; CAN utf8; utf8 dataset; jeuDonnées CESD Data Manager / DSEC Gestionnaire de données Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Data Manager Gestionnaire de données 125 Marine Science Drive 125 promenade Marine Science St. Andrews New Brunswick Nouveau-Brunswick E5B 0E4 Canada Canada (le) DFO.CESDDataRequest-DSECDemandededonnes.MPO@dfo-mpo.gc.ca DFO.CESDDataRequest-DSECDemandededonnes.MPO@dfo-mpo.gc.ca https pointOfContact; contact 2026-05-13T10:29:00.542409Z North American Profile of ISO 19115:2003 - Geographic information - Metadata Profil nord-américain de la norme ISO 19115:2003 - Information géographique - Métadonnées CAN/CGSB-171.100-2009 French; Français Canada; Canada utf8; utf8 EPSG:4326 https://epsg.io 8.2.6 Monitoring regional conservation areas using paired environmental DNA and research trawl surveys Suivi des zones de conservation régionales à l'aide d'analyses d'ADN environnemental et d'études par chalutage 2026-05-19 publication; publication 2026-04-15 creation; création Nick Jeffery Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) nick.jeffery@dfo-mpo.gc.ca nick.jeffery@dfo-mpo.gc.ca principalInvestigator; chercheurPrincipal Ryan Stanley Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) ryan.stanley@dfo-mpo.gc.ca ryan.stanley@dfo-mpo.gc.ca collaborator; collaborateur DFO has committed to establishing a representative network of Marine Conservation Areas collectively comprising 30% of the EEZ by 2030. The MCT 2.0 program was established in 2021 to help achieve this target and establish long-term monitoring within Canadian conservation areas. Information on the distribution of species within a protected area is essential for the management and monitoring of a site. Decisions made on zoning, risk assessment, activity approvals and management effectiveness all require information on the distribution and status of species. The Scotian Shelf-Bay of Fundy Bioregion spans the domain of the Maritimes Region, and within it there are 8 Marine Refuges (MR), 3 Marine Protected Areas (MPA), and 2 Areas of Interest (AOI). Environmental DNA (eDNA) offers a promising approach for biodiversity monitoring that has been gaining increased attention in the marine realm. Through sampling relatively small volumes of water (~3L), eDNA can capture of millions of fragments of eDNA on specialized filters that can then be sequenced to identify the species composition of an area. eDNA metabarcoding is based on the foundations of DNA barcoding, where species are identified solely by their unique DNA sequences. This method is relatively simple, efficient (with the ability to characterize both fish and invertebrate diversity), and non-invasive, meaning there is no disruption of sensitive benthic habitats or need to dissect tissue samples from captured fish and invertebrates. eDNA has been shown to be comparable to other biodiversity censusing techniques and has the potential to rapidly conduct biodiversity surveys over a relatively large area, such as the Eastern Shore Islands AOI. The DFO Maritimes summer multispecies trawl survey is one of the longest-running data series with applications in fisheries stock assessment, and one of the only sources of data for offshore MPA design and monitoring. In this project we pair eDNA samples collected within current and proposed conservation areas with trawl catch data to create a biodiversity and animal community monitoring time series for these areas. We use eDNA and trawl catch data as complementary tools, where trawl-based catch provides information on fish abundance, size distributions and sex, and eDNA provides information on genetic diversity and can detect cryptic and rare species. Cite this data as: Jeffery, N.W. Monitoring regional conservation areas using paired environmental DNA and research trawl surveys. Published: May 2026. Coastal Ecosystems Science Division, Maritimes Region, Fisheries and Oceans Canada, Dartmouth NS. Pêches et Océans Canada (MPO) s’est engagé à établir un réseau représentatif d’aires marines de conservation représentant collectivement 30 % de la zone économique exclusive (ZEE) d’ici 2030. Le programme des objectifs de conservation marine (OCM) 2.0 a été établi en 2021 en vue d’aider à atteindre cet objectif et d’établir un suivi à long terme dans les aires de conservation canadiennes. L’information sur la répartition des espèces présentes dans une aire protégée est essentielle à la gestion et au suivi d’un site. Les décisions sur le zonage, les évaluations des risques, les approbations d’activités et l’efficacité de la gestion exigent toutes de l’information sur la répartition et l’état des espèces présentes. La biorégion du plateau néo-écossais et de la baie de Fundy, qui couvre l’ensemble de la région des Maritimes, compte huit refuges marins, trois zones de protection marines et deux sites d’intérêt. L’ADN environnemental (ADNe) constitue une approche prometteuse pour le suivi de la biodiversité, qui suscite un intérêt croissant dans le domaine marin. Des filtres spécialisés permettent de capturer des millions de fragments d’ADNe dans des échantillons d’eau relativement petits (environ trois litres). Il est ensuite possible de séquencer ces fragments pour connaître la composition des espèces présentes dans une zone. Le métacodage à barres de l’ADNe est fondé sur le codage à barres de l’ADN, qui permet d’identifier des espèces simplement à l’aide de leurs séquences d’ADN uniques. En plus d’être relativement simple, cette méthode est efficace (elle permet de caractériser à la fois la diversité des poissons et des invertébrés) et non invasive (elle ne nécessite aucune perturbation d’habitats benthiques sensibles ni aucun prélèvement de tissus sur des poissons ou des invertébrés capturés). Il a été démontré que la méthode fondée sur l’ADNe est comparable à d’autres techniques de recensement de la biodiversité et qu’elle permet de recenser rapidement la biodiversité dans des zones relativement grandes, comme le site d’intérêt des îles de la côte Est. Le relevé plurispécifique au chalut que la région des Maritimes du MPO effectue en été figure parmi les relevés en cours depuis le plus longtemps. Les données qui en sont issues servent à l’évaluation de stocks halieutiques et constituent l’une des rares sources d’information utilisées pour la planification et le suivi des aires de protection extracôtières. Dans le cadre de ce projet, nous combinons des échantillons d’ADNe prélevés dans des zones de conservation existantes et proposées avec des données sur les prises au chalut afin de créer des séries chronologiques permettant de suivre la biodiversité et les communautés d’espèces dans ces zones. Nous utilisons l’ADNe et les données sur les prises au chalut de façon complémentaire. En effet, les données sur les prises au chalut fournissent de l’information sur l’abondance, la répartition selon la taille et le sexe des poissons, tandis que l’ADNe fournit de l’information sur la diversité génétique et permet de détecter des espèces cryptiques et rares. Citer ces données comme: Jeffery, N.W. Publié en may 2026. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É). onGoing; enContinue asNeeded; auBesoin https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/91baebd7-0832-455c-a4bf-67a1d0d6672d/attachments/Thumbnail.jpg Summer 2025 Maritimes sample stations Stations d'échantillonnage dans les Maritimes, été 2025 Marine Conservation Target Objectifs de Conservation Marine Trawl survey Au chalut eDNA ADNe Marine refuges Sanctuaires marins Marine conservation areas Aire marine de conservation Genetics Génétique theme; thème Government of Canada Core Subject Thesaurus Thésaurus des sujets de base du gouvernement du Canada 2004 publication; publication 2016-07-04 creation;création geonetwork.thesaurus.external.theme.GC_Core_Subject Government of Canada; Library and Archives Canada Gouvernement du Canada; Bibliothèque et Archives Canada custodian; conservateur Open Government Licence - Canada (http://open.canada.ca/en/open-government-licence-canada) Licence du gouvernement ouvert - Canada (http://ouvert.canada.ca/fr/licence-du-gouvernement-ouvert-canada) license; licence license; licence unclassified; nonClassifié vector; vecteur eng; CAN utf8; utf8 oceans biota environment 2023-07-01 2025-08-20 -67.36975849 -58.86365956 42.84489829 46.20501443 ESRI REST 2.9.8 CSV 1 FGDB/GDB 2.9.8 ZIP N/A Data Acquisition Assembly and Distribution / Acquisition, assemblage et distribution de donnée Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) DataServicesDonnees@dfo-mpo.gc.ca DataServicesDonnees@dfo-mpo.gc.ca https distributor; distributeur https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/91baebd7-0832-455c-a4bf-67a1d0d6672d/attachments/COI-1%20MiSeq.zip HTTPS COI-1 Sequence Séquence COI-1 Dataset;ZIP;zxx Données;ZIP;zxx https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/91baebd7-0832-455c-a4bf-67a1d0d6672d/attachments/12S%20MiSeq.zip HTTPS 12S Sequence Séquence 12S Dataset;ZIP;zxx Données;ZIP;zxx https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/91baebd7-0832-455c-a4bf-67a1d0d6672d/attachments/2025%20Offshore%20eDNA%20Sample%20Metadata.zip HTTPS 2025 Offshore eDNA sample metadata Métadonnées des échantillons d'ADN environnemental en mer (2025) Dataset;ZIP;eng,fra Données;ZIP;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/91baebd7-0832-455c-a4bf-67a1d0d6672d/attachments/Summer_sample_stations_2025.zip HTTPS Summer 2025 Maritimes sample stations Stations d'échantillonnage dans les Maritimes, été 2025 Dataset;FGDB/GDB;eng,fra Données;FGDB/GDB;eng,fra https://egisp.dfo-mpo.gc.ca/arcgis/rest/services/open_data_donnees_ouvertes/monitoring_regional_ca_paired_edna_research_trawl_surveys/MapServer ESRI REST: Map Service Monitoring regional conservation areas using paired environmental DNA and research trawl surveys Suivi des zones de conservation régionales à l'aide d'analyses d'ADN environnemental et d'études par chalutage Web Service;ESRI REST;eng Service Web;ESRI REST;eng https://egisp.dfo-mpo.gc.ca/arcgis/rest/services/open_data_donnees_ouvertes/monitoring_regional_ca_paired_edna_research_trawl_surveys/MapServer ESRI REST: Map Service Monitoring regional conservation areas using paired environmental DNA and research trawl surveys Suivi des zones de conservation régionales à l'aide d'analyses d'ADN environnemental et d'études par chalutage Web Service;ESRI REST;fra Service Web;ESRI REST;fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/91baebd7-0832-455c-a4bf-67a1d0d6672d/attachments/Data_dictionary.csv HTTPS Data dicationary Dictionnaire de données Supporting Document;CSV;eng,fra Document de soutien;CSV;eng,fra