94496446-dff8-4e14-b6b1-ea8d06e989d0 eng; CAN utf8; utf8 dataset; jeuDonnées CESD Data Manager / DSEC Gestionnaire de données Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Data Manager Gestionnaire de données 125 Marine Science Drive 125, promenade Marine Science St. Andrews New Brunswick Nouveau-Brunswick E5B 0E4 Canada Canada (le) DFO.CESDDataRequest-DSECDemandededonnes.MPO@dfo-mpo.gc.ca DFO.CESDDataRequest-DSECDemandededonnes.MPO@dfo-mpo.gc.ca https pointOfContact; contact 2025-01-31T00:30:31.232Z North American Profile of ISO 19115:2003 - Geographic information - Metadata Profil nord-américain de la norme ISO 19115:2003 - Information géographique - Métadonnées CAN/CGSB-171.100-2009 French; Français Canada; Canada utf8; utf8 EPSG:4326 https://epsg.io 8.2.6 Monitoring bay-scale bivalve aquaculture ecosystem interactions using flow cytometry Surveillance des interactions des écosystèmes d’aquaculture de bivalves à l’échelle de la baie au moyen de la cytométrie en flux 2024-10-16 publication; publication 2024-08-19 creation; création Anaïs Lacoursière-Roussel Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) 125 Marine Science Drive 125, promenade Marine Science St. Andrews New Brunswick Nouveau-Brunswick E5B 0E4 Canada Canada (le) Anais.Lacoursiere@dfo-mpo.gc.ca Anais.Lacoursiere@dfo-mpo.gc.ca principalInvestigator; chercheurPrincipal Bay-scale empirical demonstrations of how bivalve aquaculture alters plankton composition, and subsequently ecological functioning and higher trophic levels, are lacking. Temporal, inter- and within-bay variation in hydrodynamic, environmental, and aquaculture pressure limit efficient plankton monitoring design to detect bay-scale changes and inform aquaculture ecosystem interactions. Here, we used flow cytometry to investigate spatio-temporal variations in bacteria and phytoplankton (< 20 µm) composition in four bivalve aquaculture embayments. We observed higher abundances of bacteria and phytoplankton in shallow embayments that experienced greater freshwater and nutrient inputs. Depleted nutrient conditions may have led to the dominance of picophytoplankton cells, which showed strong within-bay variation as a function of riverine vs freshwater influence and nutrient availability. Although environmental forcings appeared to be a strong driver of spatio-temporal trends, results showed that bivalve aquaculture may reduce near-lease phytoplankton abundance and favor bacterial growth. We discuss aquaculture pathways of effects such as grazing, benthic-pelagic coupling processes, and microbial biogeochemical cycling. Conclusions provide guidance on optimal sampling considerations using flow cytometry in aquaculture sites based on embayment geomorphology and hydrodynamics. Cite this data as: Sharpe H, Lacoursière-Roussel A, Barrell J (2024). Monitoring bay-scale bivalve aquaculture ecosystem interactions using flow cytometry. Version 1.2. Fisheries and Oceans Canada. Samplingevent dataset. https://ipt.iobis.org/obiscanada/resource?r=monitoring_bay-scale_bivalve_aquaculture_ecosystem_interactions_using_flow_cytometry&v=1.2 Il n’existe pas de données empiriques à l’échelle de la baie sur la manière dont l’aquaculture des bivalves modifie la composition du plancton et, par conséquent, le fonctionnement écologique et les niveaux trophiques supérieurs. Les variations temporelles, inter et intrabaie des pressions hydrodynamiques, environnementales et aquacoles limitent l’efficacité de la surveillance du plancton visant à détecter les changements à l’échelle de la baie et éclairer les interactions de l’écosystème aquacole. Ici, nous avons utilisé la cytométrie en flux pour étudier les variations spatio-temporelles de la composition des bactéries et du phytoplancton (< 20 µm) dans quatre échancrures d’aquaculture de bivalves. Nous avons observé une plus forte abondance de bactéries et de phytoplancton dans les échancrures peu profondes où l’eau douce et les nutriments étaient plus abondants. L’appauvrissement des éléments nutritifs peut avoir mené à la dominance des cellules de picophytoplankton, qui ont montré une forte variation à l’intérieur de la baie en fonction de l’influence fluviale par rapport à celle de l’eau douce et de la disponibilité des éléments nutritifs. Bien que les forçages environnementaux semblent être un facteur important des tendances spatio-temporelles, les résultats ont montré que l’aquaculture de bivalves peut réduire l’abondance du phytoplancton à proximité des zones de concession et favoriser la croissance bactérienne. Nous discutons des séquences des effets de l’aquaculture, comme le broutage, les processus de couplage benthique-pélagique et le cycle biogéochimique microbien. Les conclusions fournissent des indications sur les considérations optimales d’échantillonnage utilisant la cytométrie en flux dans les sites d’aquaculture en fonction de la géomorphologie et de l’hydrodynamique des échancrures. Citer ces données comme: Sharpe H, Lacoursière-Roussel A, Barrell J (2024). Monitoring bay-scale bivalve aquaculture ecosystem interactions using flow cytometry. Version 1.2. Fisheries and Oceans Canada. Samplingevent dataset. https://ipt.iobis.org/obiscanada/resource?r=monitoring_bay-scale_bivalve_aquaculture_ecosystem_interactions_using_flow_cytometry&v=1.2 completed; complété notPlanned; nonPlanifié https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/94496446-dff8-4e14-b6b1-ea8d06e989d0/attachments/Thumbnail.PNG Location of the sampling stations within four embayments in Atlantic Canada between 2021 and 2022 Localisation des stations d'échantillonnage dans quatre baies du Canada atlantique entre 2021 et 2022 Phytoplankton Phytoplancton Aquaculture Aquaculture Oceans Océan Ecosystems Écosystème Coastal waters Eaux côtières Bacteria Bactérie theme; thème Government of Canada Core Subject Thesaurus Thésaurus des sujets de base du gouvernement du Canada 2004 publication; publication 2016-07-04 creation;création geonetwork.thesaurus.external.theme.GC_Core_Subject Government of Canada; Library and Archives Canada Gouvernement du Canada; Bibliothèque et Archives Canada custodian; conservateur Nova Scotia Nouvelle-Écosse New Brunswick Nouveau-Brunswick theme; thème Canada/US States and Provinces Canada/US États et provinces 2024-11-12 publication; publication 2024-11-12 creation;création geonetwork.thesaurus.external.theme.GC_State_Province Government of Canada; Library and Archives Canada Gouvernement du Canada; Bibliothèque et Archives Canada custodian; conservateur Open Government Licence - Canada (http://open.canada.ca/en/open-government-licence-canada) Licence du gouvernement ouvert - Canada (http://ouvert.canada.ca/fr/licence-du-gouvernement-ouvert-canada) license; licence license; licence unclassified; nonClassifié vector; vecteur eng; CAN utf8; utf8 biota oceans environment 2021-06-24 2022-11-09 -64.9989 -61.0837 45.0713 46.5397 ESRI REST 2.9.8 CSV 1 FGDB/GDB 2.9.8 Data Acquisition Assembly and Distribution / Acquisition, assemblage et distribution de donnée Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 L'institut océanographique de Bedford, C.P. 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) DataServicesDonnees@dfo-mpo.gc.ca DataServicesDonnees@dfo-mpo.gc.ca https distributor; distributeur https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/94496446-dff8-4e14-b6b1-ea8d06e989d0/attachments/Event.csv HTTPS Event data for the monitoring bay-scale bivalve aquaculture ecosystem interactions using flow cytometry Données d'événements pour le suivi des interactions de l'écosystème de l'aquaculture de bivalves à l'échelle de la baie à l'aide de la cytométrie de flux Dataset;CSV;eng,fra Données;CSV;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/94496446-dff8-4e14-b6b1-ea8d06e989d0/attachments/ExtendedMeasurementOrFact.csv HTTPS Monitoring bay-scale bivalve aquaculture ecosystem interactions using flow cytometry extended measurement or facts data Suivi des interactions entre les écosystèmes d'aquaculture de bivalves à l'échelle de la baie à l'aide de la cytométrie en flux, de mesures étendues ou de données factuelles Dataset;CSV;eng,fra Données;CSV;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/94496446-dff8-4e14-b6b1-ea8d06e989d0/attachments/Occurrence.csv HTTPS Occurrence data for the monitoring bay-scale bivalve aquaculture ecosystem interactions using flow cytometry occurrence data Données d'occurrence pour le suivi des interactions de l'écosystème de l'aquaculture de bivalves à l'échelle de la baie à l'aide de la cytométrie de flux Dataset;CSV;eng,fra Données;CSV;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/94496446-dff8-4e14-b6b1-ea8d06e989d0/attachments/Monitoring_bivalve_aquaculture_flow_cytometry.zip HTTPS Event data for the monitoring bay-scale bivalve aquaculture ecosystem interactions using flow cytometry Données d'événements pour le suivi des interactions de l'écosystème de l'aquaculture de bivalves à l'échelle de la baie à l'aide de la cytométrie de flux Dataset;FGDB/GDB;eng,fra Données;FGDB/GDB;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/94496446-dff8-4e14-b6b1-ea8d06e989d0/attachments/Data_Dictionary.csv HTTP Data dictionary Dictionnaire de données Supporting Document;CSV;eng,fra Document de soutien;CSV;eng,fra https://egisp.dfo-mpo.gc.ca/arcgis/rest/services/open_data_donnees_ouvertes/monitoring_bivalve_aquaculture_ecosystem/MapServer ESRI REST: Map Service Monitoring bay-scale bivalve aquaculture ecosystem interactions using flow cytometry Surveillance des interactions des écosystèmes d’aquaculture de bivalves à l’échelle de la baie au moyen de la cytométrie en flux Web Service;ESRI REST;eng Service Web;ESRI REST;eng https://egisp.dfo-mpo.gc.ca/arcgis/rest/services/open_data_donnees_ouvertes/monitoring_bivalve_aquaculture_ecosystem/MapServer ESRI REST: Map Service Monitoring bay-scale bivalve aquaculture ecosystem interactions using flow cytometry Surveillance des interactions des écosystèmes d’aquaculture de bivalves à l’échelle de la baie au moyen de la cytométrie en flux Web Service;ESRI REST;fra Service Web;ESRI REST;fra