c9c56d6b-afe6-4a5f-94e4-845c58f403bd eng; CAN utf8; utf8 dataset; jeuDonnées Jessica Nephin Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Ecosystems and Oceans Science/Pacific Science//Ecosystem Science Division/ Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Sciences des écosystèmes et des océans/Sciences du Pacifique//Division des sciences des écosystèmes/ Biologist Biologiste 250-363-6564 250-363-6564 Institute of Ocean Sciences 9860 West Saanich Road P.O. Box 6000 Institut des sciences de la mer 9860 chemin West Saanich C.P. 6000 Sidney British Columbia Colombie-Britannique V8L 5T5 Canada Canada (le) jessica.nephin@dfo-mpo.gc.ca jessica.nephin@dfo-mpo.gc.ca http pointOfContact; contact 2025-02-04T20:05:01.915Z North American Profile of ISO 19115:2003 - Geographic information - Metadata Profil nord-américain de la norme ISO 19115:2003 - Information géographique - Métadonnées CAN/CGSB-171.100-2009 French; Français Canada; Canada utf8; utf8 EPSG:4326 https://epsg.io Coastwide distribution of Dungeness crab Répartition du crabe dormeur à l’échelle de la côte 2024-03-04 publication; publication 2023-10-09 creation; création Jessica Nephin Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Ecosystems and Oceans Science/Pacific Science/Ecosystem Science Division/ Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Sciences des écosystèmes et des océans/Sciences du Pacifique/Division des sciences des écosystèmes/ Biologist Biologiste 250-363-6564 250-363-6564 Institute of Ocean Sciences 9860 West Saanich Road P.O. Box 6000 Institut des sciences de la mer 9860 chemin West Saanich C.P. 6000 Sidney British Columbia Colombie-Britannique V8L 4B2 Canada Canada (le) jessica.nephin@dfo-mpo.gc.ca jessica.nephin@dfo-mpo.gc.ca http originator; auteur This dataset contains two geotiff layers. The first layer (1) represents the coastwide distribution of Dungeness crab as predicted from a geostatistical model. The model predicts the mean coastwide probability of Dungeness crab detection using trap sampling gear. The second layer (2) represent the uncertainty in those predictions. Detailed descriptions of these data products can be found in Nephin et al. (2023) and the code used to produce them can be found at https://gitlab.com/dfo-msea/dungeness-sdm/. The objectives of this work was to model the habitat of Dungeness crab (_Metacarcinus magister_), a data-limited coastal marine species, to evaluate the efficacy of data integration when making predictions to geographic areas larger than the area covered by any one data source. In British Columbia, Dungeness crab are sampled regionally and sporadically with a variety of sampling gears and survey protocols, making them an ideal case study to investigate whether the integration of disparate surveys can improve habitat predictions. To that aim, we assemble data from dive, trawl, and baited-trap surveys to generate six candidate generalized linear mixed-effect models with spatial random fields. This dataset contains the mean (1) and difference (2) between the Survey-effect and Gear-effect model predictions. Cet ensemble de données contient deux couches géotiff. La première couche (1) représente la répartition du crabe dormeur à l'échelle de la côte, telle qu'elle est prédite à partir d'un modèle géostatistique. Le modèle prédit la probabilité moyenne de détection du crabe dormeur sur l'ensemble de la côte à l'aide d'engins d'échantillonnage piégeants. La deuxième couche (2) représente l'incertitude associée à ces prévisions. Des descriptions détaillées de ces produits de données se trouvent dans Nephin et al. (2023) et le code utilisé pour les produire est disponible à l'adresse suivante : https://gitlab.com/dfo-msea/dungeness-sdm/. Les objectifs de ce travail étaient de modéliser l'habitat du crabe dormeur (_Metacarcinus magister_), une espèce marine côtière limitée aux données, afin d'évaluer l'efficacité de l'intégration des données lorsqu'on fait des prévisions pour des zones géographiques plus vastes que la superficie couverte par une source de données. En Colombie-Britannique, le crabe dormeur est échantillonné à l'échelle régionale et sporadique à l'aide d'une variété d'engins d'échantillonnage et de protocoles de relevé, ce qui en fait une étude de cas idéale pour déterminer si l'intégration de relevés disparates peut améliorer les prévisions de l'habitat. À cette fin, nous rassemblons des données provenant de relevés de plongée, de chalut et de pièges appâtés afin de produire six modèles linéaires à effets mixtes candidats généralisés avec des champs aléatoires spatiaux. Cet ensemble de données contient la moyenne (1) et la différence (2) entre les prévisions du modèle d'enquête et de l'effet d'engrenage. completed; complété asNeeded; auBesoin https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/c9c56d6b-afe6-4a5f-94e4-845c58f403bd/attachments/DungenessCrab_prediction_thumbnail.PNG Dungeness Crab Prediction Thumbnail Prévision pour le crabe dormeur (vignette) species distribution models modèles de distribution des espèces data integration intégration des données gaussian random fields champs aléatoires gaussiens dungeness crab crabe dormeur theme; thème Models Modèle Aquatic animals Animal aquatique Marine biology Biologie marine Oceans Océan theme; thème Government of Canada Core Subject Thesaurus Thésaurus des sujets de base du gouvernement du Canada 2004 publication; publication 2016-07-04 creation;création geonetwork.thesaurus.external.theme.GC_Core_Subject Government of Canada; Library and Archives Canada Gouvernement du Canada; Bibliothèque et Archives Canada custodian; conservateur Open Government Licence - Canada (http://open.canada.ca/en/open-government-licence-canada) Licence du gouvernement ouvert - Canada (http://ouvert.canada.ca/fr/licence-du-gouvernement-ouvert-canada) license; licence license; licence vector; vecteur eng; CAN utf8; utf8 biota 2000-01-01 2021-12-31 -134.64218 -123.14497 47.9226 55.74497 We fit geostatistical models: generalized linear mixed-effect models (GLMMs) with spatial Gaussian random fields using sdmTMB in R. We modelled probability of detection using a Bernoulli model with a complementary log-log link. We sourced Dungeness crab observations from four different research surveys conducted by Fisheries and Oceans Canada and their partners: SCUBA dive multi-species surveys (dive), small-mesh trawl surveys targeting shrimp (trawl), baited-trap surveys targeting Dungeness crab (trap DC), and baited-trap surveys targeting _Carcinus maenas_, Green crab (trap GC). To model Dungeness crab distribution, we relied on environmental variables that were known or hypothesised to have an influence on the distribution of Dungeness crab: bottom depth (meters), slope (degrees), fine- and broad-scale bathymetric position index (BPI), mean bottom temperature (celcius), mean bottom salinity (Practical Salinity Unit, PSU), bottom salinity range (PSU), and substrate indices representing the amount of sandy and muddy substrate within an area. Gear-effect and Survey-effect integrated models accounted for differences between surveys with a fixed effect for sampling gear (dive, trawl, trap) or survey (dive, trawl, trap GC, trap DC). We included the Survey-effect model to assess whether sampling protocol differences between trap GC and trap DC surveys were large enough to merit a unique fixed effect for each trap survey. Detailed methods can be found in Nephin et al. (2023) and the code can be found at https://gitlab.com/dfo-msea/dungeness-sdm/. Nous avons ajusté les modèles géostatistiques : modèles linéaires généralisés à effets mixtes (MGL) avec des champs aléatoires spatiaux gaussiens en utilisant SDMTMB dans R. Nous avons modélisé la probabilité de détection à l'aide d'un modèle de Bernoulli avec un lien log-log complémentaire. Nous avons obtenu les observations du crabe dormeur dans le cadre de quatre relevés de recherche menés par Pêches et Océans Canada et ses partenaires : relevés multi-espèces en plongée sous-marine (plongée), relevés au chalut à petits mailles ciblant les crevettes (chalut), relevés au casier appâté ciblant le crabe dormeur (c.c.) et relevés au casier appâté ciblant _Carcinus maenas_, crabe vert (piège GC). Pour modéliser la répartition du crabe dormeur, nous nous sommes appuyés sur des variables environnementales connues ou supposées avoir une influence sur la répartition du crabe dormeur : profondeur du fond (mètres), pente (degrés), indice de position bathymétrique (IPC) à petite et à grande échelle, température moyenne du fond (celsius), salinité moyenne du fond (unité de salinité pratique, USP), plage de salinité du fond (USP), plage de salinité du fond (USP), et des indices de substrat représentant la quantité de substrat sableux et boueux à l'intérieur d'une zone. Les modèles intégrés à effet d'engin et à effet de relevé ont tenu compte des différences entre les relevés ayant un effet fixe pour les engins d'échantillonnage (plongée, chalut, pièges) ou les relevés (plongée, chalut, piégeage GC, piège DC). Nous avons inclus le modèle Survey-effet afin d'évaluer si les différences entre les protocoles d'échantillonnage entre les relevés du GC au piège et les relevés à courant continu étaient suffisamment importantes pour justifier un effet fixe unique pour chaque relevé au piège. Des méthodes détaillées sont disponibles dans Nephin et al. (2023) et le code est disponible à l'adresse https://gitlab.com/dfo-msea/dungeness-sdm/. TIFF unknown Kayleigh Gillespie Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Ecosystems and Oceans Science/Pacific Science/Ecosystem Science Division/ Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Sciences des écosystèmes et des océans/Sciences du Pacifique/Division des sciences des écosystèmes/ Data Steward gestionnaire des données 250-756-7202 250-756-7202 Pacific Biological Station, 3190 Hammond Bay Road La station biologique du Pacifique, 3190 chemin Hammond Bay Nanaimo British Columbia Colombie-Britannique V9T 6N7 Canada Canada (le) Kayleigh.Gillespie@dfo-mpo.gc.ca Kayleigh.Gillespie@dfo-mpo.gc.ca http distributor; distributeur https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/c9c56d6b-afe6-4a5f-94e4-845c58f403bd/attachments/dungnesscrab_prediction.zip HTTPS Coastwide distribution of Dungeness crab Aire de répartition du crabe dormeur sur toute la côte Dataset;TIFF;eng Données;TIFF;eng https://egisp.dfo-mpo.gc.ca/arcgis/rest/services/open_data_donnees_ouvertes/coastwide_distribution_of_dungeness_crab_en/MapServer ESRI REST: Map Service Coastwide distribution of Dungeness crab Aire de répartition du crabe dormeur sur toute la côte Web Service;ESRI REST;eng Service Web;ESRI REST;eng https://egisp.dfo-mpo.gc.ca/arcgis/rest/services/open_data_donnees_ouvertes/coastwide_distribution_of_dungeness_crab_fr/MapServer ESRI REST: Map Service Coastwide distribution of Dungeness crab -- French Aire de répartition du crabe dormeur sur toute la côte Web Service;ESRI REST;fra Service Web;ESRI REST;fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/c9c56d6b-afe6-4a5f-94e4-845c58f403bd/attachments/Data_Dictionary_DungenessCrab_EN_FR.pdf HTTPS Data Dictionary Dictionnaire de données Supporting Document;PDF;eng,fra Document de soutien;PDF;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/c9c56d6b-afe6-4a5f-94e4-845c58f403bd/attachments/DungenessCrab_GISHub_metadata_EN.pdf HTTPS Coastwide distribution of Dungeness crab - GISHub metadata English Répartition du crabe dormeur à l’échelle de la côte - GISHub metadata Anglais Supporting Document;PDF;eng Document de soutien;PDF;eng https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/c9c56d6b-afe6-4a5f-94e4-845c58f403bd/attachments/DungenessCrab_GISHub_metadata_FR.pdf HTTPS Coastwide distribution of Dungeness crab - GISHub metadata French Répartition du crabe dormeur à l’échelle de la côte - GISHub metadata Français Supporting Document;PDF;fra Document de soutien;PDF;fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/c9c56d6b-afe6-4a5f-94e4-845c58f403bd/attachments/References_EN_FR_DungenessCrab.pdf HTTPS REFERENCES Références Supporting Document;PDF;eng,fra Document de soutien;PDF;eng,fra