cc3e54d1-354a-4b03-8188-db64a79b7491 eng; CAN utf8; utf8 dataset; jeuDonnées CESD Data Manager / DSEC Gestionnaire de données Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Data Manager Gestionnaire de données 125 Marine Science Drive 125 promenade Marine Science St. Andrews New Brunswick Nouveau-Brunswick E5B 0E4 Canada Canada (le) DFO.CESDDataRequest-DSECDemandededonnes.MPO@dfo-mpo.gc.ca DFO.CESDDataRequest-DSECDemandededonnes.MPO@dfo-mpo.gc.ca https pointOfContact; contact 2025-05-21T14:37:11.864Z North American Profile of ISO 19115:2003 - Geographic information - Metadata Profil nord-américain de la norme ISO 19115:2003 - Information géographique - Métadonnées CAN/CGSB-171.100-2009 French; Français Canada; Canada utf8; utf8 EPSG:4326 https://epsg.io Widespread genetic similarity between Northwest Atlantic populations of the horse mussel, Modiolus modiolus Similarité génétique répandue entre les populations de modioles (Modiolus modiolus) de l’Atlantique Nord-Ouest 2025-04-02 creation; création 2025-05-16 publication; publication Ryan Stanley Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) Ryan.Stanley@dfo-mpo.gc.ca Ryan.Stanley@dfo-mpo.gc.ca https principalInvestigator; chercheurPrincipal Brendan Wringe Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Population Ecology Division (PED) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division de l'Ecologie des Populations (DEP) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) Brendan.Wringe@dfo-mpo.gc.ca Brendan.Wringe@dfo-mpo.gc.ca principalInvestigator; chercheurPrincipal Nick Jeffery Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) Nick.Jeffery@dfo-mpo.gc.ca Nick.Jeffery@dfo-mpo.gc.ca principalInvestigator; chercheurPrincipal Jessica Sameoto Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Population Ecology Division (PED) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division de l'Ecologie des Populations (DEP) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) Jessica.Sameoto@dfo-mpo.gc.ca Jessica.Sameoto@dfo-mpo.gc.ca principalInvestigator; chercheurPrincipal Mallory Van Wyngaarden Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD) Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC) Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) Mallory.VanWyngaarden@dfo-mpo.gc.ca Mallory.VanWyngaarden@dfo-mpo.gc.ca principalInvestigator; chercheurPrincipal Effective conservation planning relies on understanding population connectivity which can be informed by genomic data. This is particularly important for sessile species like the horse mussel (Modiolus modiolus), a key habitat-forming species and conservation priority in Atlantic Canada), yet little genomic information is available to describe horse mussel connectivity patterns. We used more than 8000 restriction-site associated DNA sequencing-derived single nucleotide polymorphisms and a panel of 8 microsatellites to examine genomic connectivity among horse mussel populations in the Bay of Fundy, along the Scotian Shelf, and in the broader northwestern Atlantic extending to Newfoundland. Despite phenotypic differences between sampling locations, we found an overall lack of genetic diversity and population structure in horse mussels in the Northwest Atlantic Ocean. All sampled locations had low heterozygosity, very low FST, elevated inbreeding coefficients, and deviated from Hardy-Weinberg Equilibrium, highlighting generally low genetic diversity across all metrics. Principal components analysis, Admixture analysis, pairwise FST calculations, and analysis of outlier loci (potentially under selection) all showed no independent genomic clusters within the data, and an analysis of molecular variance showed that less than 1% of the variation within the SNP dataset was found between sampling locations. Our results suggest that connectivity is high among horse mussel populations in the Northwest Atlantic, and coupled with large effective population sizes, this has resulted in minimal genomic divergence across the region. These results can inform conservation design considerations in the Bay of Fundy and support further integration into the broader regional conservation network. Cite this data as: Van Wyngaarden, Mallory et al. (2024). Widespread genetic similarity between Northwest Atlantic populations of the horse mussel, Modiolus modiolus. Published: May 2025. Coastal Ecosystem Science Division, Maritimes Region, Fisheries and Oceans Canada, Dartmouth, NS. Une planification efficace de la conservation repose sur la compréhension de la connectivité entre les populations, qui peut être documentée par des données génomiques. Ceci est particulièrement important pour les espèces sessiles comme la modiole (Modiolus modiolus), une espèce essentielle à la formation de certains habitats qui constitue une priorité en matière de conservation au Canada atlantique. Cependant, peu d’informations génomiques sont disponibles pour décrire les tendances en matière de connectivité de la modiole. Nous avons utilisé plus de 8 000 polymorphismes mononucléotidiques dérivés du séquençage de l’ADN associé aux sites de restriction et un ensemble de 8 microsatellites pour examiner la connectivité génomique entre les populations de modioles dans la baie de Fundy, le long du plateau néo-écossais et dans l’Atlantique Nord-Ouest, jusqu’à Terre-Neuve. Malgré les différences phénotypiques entre les lieux d’échantillonnage, nous avons constaté un manque général de diversité génétique et de structure démographique chez les modioles dans l’Atlantique Nord-Ouest. Tous les sites échantillonnés présentaient une faible hétérozygosité, un très faible FST, des coefficients de consanguinité élevés et un écart par rapport à l’équilibre Hardy-Weinberg, ce qui met en évidence la diversité génétique généralement faible pour tous les paramètres mesurés. L’analyse des composantes principales, l’analyse du métissage, les calculs par paires du FST et l’analyse des loci aberrants (pouvant faire l’objet d’une sélection) n’ont révélé aucun groupe génomique indépendant dans les données, et une analyse de la variation moléculaire a montré que moins de 1 % de la variation observée dans l’ensemble de données sur les SNP était constatée entre les sites d’échantillonnage. Nos résultats suggèrent que la connectivité est élevée entre les populations de modioles de l’Atlantique Nord-Ouest, ce qui, conjugué à des tailles de population réelles importantes, a entraîné une divergence génomique minimale dans la région. Ces résultats peuvent éclairer les considérations relatives à la conception de mesures de conservation dans la baie de Fundy et favoriser une meilleure intégration dans l’ensemble du réseau régional de conservation. Citer ces données comme: an Wyngaarden, Mallory et al. (2024).Similarité génétique répandue entre les populations de modioles (Modiolus modiolus) de l’Atlantique Nord-Ouest. Publié en Mai 2025. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É). completed; complété notPlanned; nonPlanifié https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/cc3e54d1-354a-4b03-8188-db64a79b7491/attachments/Thumbnail.jpg Sampling locations Lieux d'échantillonnage Modiolus modiolus Modiolus modiolus Microsatellites Microsatellites Single nucleotide polymorphisms Polymorphismes d’un seul nucléotide Marine Conservation Target Objectifs de Conservation Marine Oceans Océan Environment Environnement Marine conservation areas Aire marine de conservation Genetics Génétique Genomics Génomique theme; thème Government of Canada Core Subject Thesaurus Thésaurus des sujets de base du gouvernement du Canada 2004 publication; publication 2016-07-04 creation;création geonetwork.thesaurus.external.theme.GC_Core_Subject Government of Canada; Library and Archives Canada Gouvernement du Canada; Bibliothèque et Archives Canada custodian; conservateur Northwest Atlantic Ocean (40W) Northwest Atlantic Ocean (40W) Continents, countries, sea regions of the world. Continents, countries, sea regions of the world. 2015-07-17 publication; publication 2015-01-01 creation;création geonetwork.thesaurus.external.place.regions Unknown Unknown custodian; conservateur Open Government Licence - Canada (http://open.canada.ca/en/open-government-licence-canada) Licence du gouvernement ouvert - Canada (http://ouvert.canada.ca/fr/licence-du-gouvernement-ouvert-canada) license; licence license; licence unclassified; nonClassifié vector; vecteur eng; CAN biota environment oceans 2022-06-28 2023-06-01 -67.43765752 -52.24898952 43.29106714 50.29790458 ESRI REST 2.9.8 FGDB/GDB 2.9.8 CSV 1 ZIP 1 Data Acquisition Assembly and Distribution / Acquisition, assemblage et distribution de donnée Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada Bedford Institute of Oceanography, 1 Challenger Drive, PO Box 1006 Institut océanographique de Bedford, 1, promenade Challenger, Boîte postale 1006 Dartmouth Nova Scotia Nouvelle-Écosse B2Y 4A2 Canada Canada (le) DataServicesDonnees@dfo-mpo.gc.ca DataServicesDonnees@dfo-mpo.gc.ca https distributor; distributeur https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/cc3e54d1-354a-4b03-8188-db64a79b7491/attachments/Modiolus.AllSNPs.genepop.gen.gz HTTPS Population genetics of unfiltered SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) Génétique des populations des SNP non filtrés (polymorphismes de nucléotides simples) Dataset;ZIP;eng Données;ZIP;eng https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/cc3e54d1-354a-4b03-8188-db64a79b7491/attachments/Modiolus.FilteredSNPs.genepop.gen.gz HTTPS Population genetics of filtered SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) Génétique des populations des SNP (Polymorphismes Nucléotidiques Uniques) filtrés Dataset;ZIP;eng Données;ZIP;eng https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/cc3e54d1-354a-4b03-8188-db64a79b7491/attachments/Modiolus.Microsats.genepop.gen HTTPS Population genetics of microsatellites Génétique des populations de microsatellites Dataset;ZIP;eng Données;ZIP;eng https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/cc3e54d1-354a-4b03-8188-db64a79b7491/attachments/Data_dictionary.csv HTTPS Data dictionary Dictionnaire de données Supporting Document;CSV;eng,fra Document de soutien;CSV;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/cc3e54d1-354a-4b03-8188-db64a79b7491/attachments/Widespread_genetic_Northwest_Atlantic_horse_mussel.zip HTTPS Horse mussel samples locations Emplacement des échantillons de modiole Dataset;FGDB/GDB;eng,fra Données;FGDB/GDB;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/cc3e54d1-354a-4b03-8188-db64a79b7491/attachments/Modiolus_Indexes.csv HTTPS Modiolus RAD indexes Indices RAD de modiole Dataset;CSV;eng,fra Données;CSV;eng,fra https://api-proxy.edh-cde.dfo-mpo.gc.ca/catalogue/records/cc3e54d1-354a-4b03-8188-db64a79b7491/attachments/Modiolus_Samples.csv HTTPS Modiolus sample metadata Métadonnées de l'échantillon modiole Dataset;CSV;eng,fra Données;CSV;eng,fra https://egisp.dfo-mpo.gc.ca/arcgis/rest/services/open_data_donnees_ouvertes/widespread_genetic_nw_atlantic_horse_mussel/MapServer ESRI REST: Map Service Widespread genetic similarity between Northwest Atlantic populations of the horse mussel, Modiolus modiolus Similarité génétique répandue entre les populations de modioles (Modiolus modiolus) de l’Atlantique Nord-Ouest Web Service;ESRI REST;eng Web Service;ESRI REST;eng https://egisp.dfo-mpo.gc.ca/arcgis/rest/services/open_data_donnees_ouvertes/widespread_genetic_nw_atlantic_horse_mussel/MapServer ESRI REST: Map Service Widespread genetic similarity between Northwest Atlantic populations of the horse mussel, Modiolus modiolus Similarité génétique répandue entre les populations de modioles (Modiolus modiolus) de l’Atlantique Nord-Ouest Web Service;ESRI REST;fra Web Service;ESRI REST;fra